同济大学医学院/附属上海市肺科医院教授张鹏团队、中国科学院上海药物研究所研究员周虎团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员季红斌团队、高大明团队合作，首次在国际上大规模表征小细胞肺癌的蛋白组学图谱，为小细胞肺癌个性化治疗带来福音。研究结果于1月5日在线发表于《细胞》，这也是中国学者2024年在《细胞》上的开篇之作。
图片来源于《细胞》
研究团队对112例小细胞肺癌患者的肿瘤组织和配对癌旁组织样本进行了蛋白基因组学分析，通过整合基因组、转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组等多维组学数据，系统揭示了小细胞肺癌的分子特征，为小细胞肺癌的发生发展机制、预后监测、分子分型和个性化治疗策略提供了新思路。
进一步对蛋白质组学数据进行监督分析筛选预后相关生物标志物，研究人员发现HMGB3的高表达与患者不良预后密切相关，并通过免疫组化实验在独立队列临床样本中得以验证。机制研究表明，HMGB3可通过转录调控细胞连接（cell-junction）相关基因表达促进小细胞肺癌的细胞迁移。
其次，研究人员系统分析了小细胞肺癌的免疫微环境特征，发现ZFHX3突变与免疫细胞浸润水平升高密切相关。更重要的是，在接受PD-1或PD-L1抑制剂联合化疗的小细胞肺癌临床试验患者肿瘤样本中，证实了ZFHX3突变患者具有更好的治疗响应，提示ZFHX3突变或可作为小细胞肺癌免疫治疗受益的生物标志物。
最后，研究人员利用多组学数据将小细胞肺癌分为4个亚型，系统表征了各亚型独特的分子特征并提出了潜在治疗策略。这些分子分型指导的特异性治疗策略通过患者样本来源肿瘤的小鼠移植瘤模型和人小细胞肺癌细胞系来源的小鼠移植瘤模型得以验证。
该研究是国际上首次大规模对小细胞肺癌临床队列开展蛋白质组和磷酸化蛋白质组表征，这些研究成果为小细胞肺癌的病理机制解析、预后检测、分子分型及个性化治疗提供了理论依据，同时产生的高质量大数据将为广大小细胞肺癌基础与临床研究者提供支持，推动小细胞肺癌研究领域的发展。